После победы над боссом первого этажа Кирито и Асуна продолжают продвигаться по Айнкраду — гигантской парящей крепости, из которой невозможно выбраться без прохождения всех ста уровней. Теперь их ждёт пятый этаж, где фронтовики готовятся к очередному рейду на босса. Однако обстановка среди сильнейших игроков становится всё напряжённее: между гильдиями «Рыцари Дракона» и «Отряд освобождения Айнкрада» разгорается конфликт из‑за распределения ресурсов и лидерства на передовой.

В разгар подготовки Асуна встречает старую знакомую Мито, с которой её связывает трагичное прошлое, а Кирито оказывается втянут в расследование загадочных событий, происходящих вокруг рейдовой группы. Пока игроки спорят и пытаются найти виновных, время неумолимо идёт вперёд, а любая задержка означает новые жертвы среди запертых в «SAO» людей.

Героям предстоит не только участвовать в опасных рейдах, но и попытаться предотвратить раскол среди тех, от кого зависит судьба тысяч людей. В мире, где смерть в игре означает смерть в реальности, даже союзники могут оказаться источником новой угрозы.