Операция может использоваться как крайняя мера у людей, которые не улучшаются другими методами лечения. В этой процедуре хирургическое поражение происходит в области мозга (поясной коре). В одном исследовании 30% участников получили значительную пользу от этой процедуры. Глубокая стимуляция мозга и стимуляция блуждающего нерва — возможные хирургические методы, не требующие разрушения мозговой ткани. Однако, поскольку глубокая стимуляция мозга приводит к столь мгновенным и интенсивным изменениям, после этого человек может столкнуться с трудностями с идентификацией. В Соединённых Штатах FDA одобрило глубокую стимуляцию мозга для лечения ОКР в рамках исключения для гуманитарных устройств, требуя, чтобы процедура проводилась только в больнице с особыми квалификациями