Ну давай разберем по частям, тобою написанное ©

Псевдо-Рафал после убийства толкает речь про свои намерения, а также про намерения отца Альберта. Видно, что эти намерения противоположны друг другу, из-за чего и произошёл конфликт. При этом убеждения "Рафала" остались прежними, но приобрели более радикальные формы. Поэтому мне и кажется, что Рафала добавили именно что показать альтернативный сценарий — каким мог бы вырасти Рафал, если бы он избежал казни и при этом сохранил свои взгляды? Куда это могло бы его привести?

Идём дальше. Противопоставление "главные герои — Новак" видно невооружённым глазом. Другое противопоставление, "отец Альберта — новый Рафал", думаю, тоже очевидно (их напрямую сравнивают в последней серии). От себя я добавил лишь то, что между этими противопоставлениями можно провести кучу параллелей — и в предыдущем комменте я уже писал, почему это имеет место быть. Если этого мало, можно обратиться всё к той же последней серии. 09:52, сидя на исповеди и вспоминая произошедшее, Альберт говорит:


Отец Альберта продвигает сомнение, псевдо-Рафал продвигает веру. Диаметрально противоположные вещи. Это не взято из головы — в 24-25 сериях оба персонажа сами рассказывают, за какую идею "выступают" и почему. Но мне влом искать и приводить их полные цитаты, поэтому я ограничусь обобщением Альберта.

А теперь смотрим на прошлое противопоставление — разве эти темы, "сомнение" и "вера", не отлично ложатся на главных героев и Новака? Главные герои подвергают общепринятую точку зрения сомнению — Новак же верит ей (в том смысле, что "принимает без доказательств"). В этом и всё различие между ними. Эти персонажи спокойно могли бы стоять на других сторонах баррикад, сложись судьба иначе. Вроде, Новак в предсмертной беседе с иллюзией-Рафалом даже говорит об этом.

И последняя арка с псевдо-Рафалом как раз это иллюстрирует. Кто теперь тут "злодей", кем теперь движет непримиримая вера? Псевдо-Рафал имел иные догматы, нежели Новак — но это всё ещё догматы. Шило (религию и обскурантизм) заменили на мыло (наука и прогрессивизм), а суть-то осталась прежней.

Ну и последний абзац, что тайтл продвигает серую мораль... Если всего, что я уже написал ранее, недостаточно, то вот речь Альберта ближе к концу последней серии (17:58):

Рафала сожгли так-то, он уже давно не чиллит в камере
В последних сериях вместо "Рафала" вполне мог бы быть другой персонаж с такой же ролью, идеями и намерениями. Просто создатели решили переиспользовать чардиз и сейю Рафала (видимо, как раз чтобы добавить всю эту линию с "а что если бы Рафал вырос").

То, что вся эта ситуация была бы абсурдным стечением обстоятельств... "Реальность страннее вымысла, потому что вымысел обязан быть правдоподобным, а реальность — нет"