@Негр Василий, по порядку манги:
Главы с акрой Бакусай тенкецу и Чайной церемонией (обе возвращаются в 3 сезоне);
главы с Хаппосаем несколько подрезаны, а 65 с баней отсутствует полностью;
арка с поиском скрытого источника, 3 главы, с 78 по 80 (Пока её в 3 сезоне не видно);
арка с печеньем и Кодачи (возвращается в 3 сезоне);
пляжная арка с пилюлями любви (возвращается в 3 сезоне).
Это пожалуй всё.