Аниме рассказывает о 13-летнем школьнике Сюити Нитори, который любит переодеваться в девичью одежду и хочет стать девушкой. Раньше, когда Нитори так делал, он преображался в миленькую девочку, но наступает период взросления, и такие перемены как высокий рост, первые ростки щетины на подбородке и ломающийся голос грозят уничтожить всю его милашность.

Параллельно с этими тревогами Нитори проходит через сложный пусть самоопределения. Он хочет считать себя девочкой, но по-настоящему понимает его душевные терзания только Ёсино Такацуки - подруга детства и одноклассница Нитори, которая любит переодеваться в мальчишескую одежду, хочет стать мальчиком и болезненно переживает то, что у неё растёт грудь.

На протяжении всего сюжета Нитори колеблется кем же ему быть - девушкой, следуя зову сердца, или парнем, подчиняясь общественному давлению. Именно этому и посвящено всё аниме - душевным волнениям мальчика, который не такой, как все, но тоже хочет быть счастливым. История получилась очень реалистичной и волнующей, пусть и без чёткого конца. Для любителей очень неоднозначных психологических драм «Блудный сын» станет настоящим подарком.