1. Почему Гурэн продолжал вести себя ненормально, хотя злодеи были убиты,и заклинание должно было перестать действовать?

Потому что заклинание для подчинения воли было использовано для похищения Гурэна. А потом его поместили в миазмы Преисподней, которые убивают душу и превращают в чудовище. Форму ему сохранили только для того, чтобы он открыл печать. Поэтому и было только 2 варианта: убить его, чтобы переродился, или ждать, когда миазмы полностью уничтожат его душу.

2. Зачем Масахиро жертвовал собой, если Тоуда и так бы возродился?

Потому что для Масахиро остаться без воспоминаний - это умереть. Если проще: Тоуда возродился, Масахиро своей жертвой спас Гурэна, а вот Моккун умер, так как Масахиро стëр все воспоминания о себе.
Выходит, если в начале истории Моккун относился к Масахиро с чувством благодарности, а тот вообще не помнил их прошлые взаимоотношения, то в конце герои меняются местами.